光化一年六月一日，在第一次的早朝上，朱慈烺提出了本朝的六部人選，
內(nèi)閣首輔史可法
兵部尚書陳子龍為大明京營總指揮，黃得功為兵部侍郎兼京營副總指揮
文華殿大學(xué)士兼戶部尚書堵胤錫
吏部尚書方國安，每年負責科舉的開展
禮部尚書程璧，負責大明典禮以及宗室，管理大明錢莊
刑部尚書劉宗周
工部尚書宋應(yīng)元
方元科任職錦衣衛(wèi)督指揮使
在對大明內(nèi)閣人員的重新任命以后，重新設(shè)立行省制度，將江蘇浙江安徽進行直轄改名為南直隸，重新恢復(fù)征稅，南直隸年總賦稅400萬兩，江西賦稅100萬兩，湖北賦稅50萬兩，湖南賦稅50萬兩，福建和廣東賦稅因地方擁兵自重沒有收上來，云南、貴州暫由沐王府沐黔管理賦稅20萬元，鹽稅100萬兩，商業(yè)稅50萬兩，合計能收上來770萬兩白銀，海關(guān)貿(mào)易由于鄭之龍家族在把持并不能正常開展，光化官員支出10萬兩，光化帝內(nèi)府支出20萬兩，養(yǎng)兵50萬人，京營20萬人士兵每年24兩銀子年支出48萬兩，兩湖防線和徐州、淮安防線各10萬人士兵每年36兩年支出36萬兩，其他地區(qū)士兵每人每年10兩支出12萬兩，
一是制定了一些經(jīng)濟措施，推行攤丁入畝，重新丈量全國田畝，按滿16歲以上的人頭進行收稅，由地方官直接收稅，推行銅錢、白銀、黃金作為貨幣，在大明錢莊推行大額官票，為了限制明朝末年土地兼并日益嚴重的情況，對于掌握100畝以下的大戶十收一，對于掌握100-150畝的大戶采取100畝五收一，150畝-200畝三收一，200畝以上收一半，限制大戶兼并土地，建立“大明錢莊”發(fā)布成化銅錢、銀錠、金錠，由程璧擔任第一任錢莊會長收攏天下商甲開分戶，并設(shè)置了大證方針“滅清”，在進行土地調(diào)整，引進番薯。將鹽、鐵、鑄幣、馬匹、茶葉、武備制作收歸中央，全國推行官商，凡私自販賣制造者，仗責一百，關(guān)押三年。統(tǒng)一度量衡，市面上所用均需經(jīng)官府核查，違者治罪；加強市場監(jiān)管，平抑物價；對于不法商人因戰(zhàn)爭哄抬物價的不法行為予以打擊，處以仗刑法加罰金；嚴禁買賣人口、販賣軍器，違者充當官府徭役。
投資50萬兩經(jīng)營官商發(fā)展絲綢廠、造紙廠、陶瓷廠，投資50萬兩在云貴、湖廣開挖銅、鐵、煤炭等礦產(chǎn)，在廣西、江西種植箭竹，在南京和武昌修建大型高爐煉鐵廠，生產(chǎn)箭頭、火繩槍、鉛彈、弩箭、弓箭、佛郎機大炮、子母炮等軍械廠合計支出100萬兩，由王承恩當監(jiān)官。
二是興辦教育，為了能使地方貫徹好立校興學(xué)政策，光化內(nèi)閣規(guī)定：南直隸設(shè)立京師大學(xué)堂招100人設(shè)武備科、政科、武科、水利科、數(shù)學(xué)、繪畫、藥科、律科，成績優(yōu)異者由朱慈烺直接任命，南直隸、江西、廣東、廣西、湖南、湖北、福建、云南、貴州八省每個設(shè)立一個省學(xué)堂招生200人，老師10人，按京師大學(xué)堂設(shè)立學(xué)科，每科學(xué)子都要學(xué)習四書五經(jīng)，兩個府學(xué)堂招生各400人按省學(xué)堂模式，與省學(xué)堂同理，所有人都可以參加科舉考試，求取功名。
三是重新恢復(fù)科舉制，設(shè)置殿試、省試、縣試三級考試，于每年六月縣試，七月省試，八月殿試，成績前20名入朝為官，每年由朱慈烺親自設(shè)考題，需要考兩科，一是內(nèi)閣部門業(yè)務(wù)測試，二是四書五經(jīng)，戶部考數(shù)學(xué)，吏部考政治，刑部考案件處理，工部考水利，兵部考武備常識和身體素質(zhì)，禮部考繪畫。
四是恢復(fù)錦衣衛(wèi)制度，錦衣衛(wèi)只對皇帝負責，并且負責皇帝的護衛(wèi)，有都指揮，省指揮，縣指揮以及巡檢司，監(jiān)察百官和商甲。
雖然堵胤錫等人對于朱慈烺推行的政策有很多不解，不過，明朝內(nèi)閣成員對于這位小皇帝的做法，制度的制定還是非常認可，持認可態(tài)度。
五是設(shè)立軍情處，直接負責對外軍事，另外，根據(jù)光化帝的意見，未來的五年之內(nèi)，將逐步在國內(nèi)建立十年制義務(wù)兵役制，滿十年進行退役，軍隊退役士兵發(fā)放農(nóng)具提供十畝耕地，回去生產(chǎn)。在南直隸練兵20萬人，由陳子龍進行統(tǒng)領(lǐng)，設(shè)置20營，每個營10000人，8000戰(zhàn)士，2000勤務(wù)兵。何騰蛟統(tǒng)領(lǐng)湖南湖北兩省兵馬10萬囤聚于武昌，在武昌和南京設(shè)置武昌軍器制造廠和南京軍器制造廠，徐州、淮安兵馬由孫守法進行統(tǒng)領(lǐng)布置防線。
對于這個安排，內(nèi)閣方面大部分人提出了反對。特別是內(nèi)閣首輔史可法，更是指責軍人就應(yīng)該一直從軍入伍，這將嚴重的阻礙經(jīng)濟和社會的發(fā)展。
但是，光化帝對此表示贊同?，F(xiàn)在的中國人，經(jīng)過了自宋朝以來近千年的統(tǒng)治，早已失去了血性，這對于一個想要成為世界強國的明朝來說，是非常不利的。朱慈烺希望借此來重新激發(fā)明朝百姓尚武的傳統(tǒng)，這對于明朝今后的對清作戰(zhàn)非常有幫助。至少明清大戰(zhàn)中，明朝不會空有龐大的軍隊數(shù)量，但是打起仗來就一哄而散。