1644年5月30日，群龍無首的泗州、徐州已經(jīng)亂作一團，所部將士暫時歸屬高杰之子高興平統(tǒng)轄。因其年幼，高杰部暫由邢夫人代掌，但江北兵馬糧餉高起潛也控制了一部分兵權(quán)，邢夫人雖然得到了左良玉的呼應(yīng)，仍處于內(nèi)無糧草支援，外無援軍助陣的絕境。朱慈烺帶領(lǐng)六萬士兵進攻時，邢夫人眼見敵不過帶著兒子高興平只帶了高家兩千家丁投奔左良玉，高起潛在高家軍棄城逃跑后已無心戀戰(zhàn)，只三日便被朱慈烺的軍隊拿下了。此時的朱慈烺已經(jīng)坐擁江蘇、浙江、安徽三個區(qū)域，實力大增。左良玉想乘朱慈烺剛剛打下的廣大地盤立足未穩(wěn)之機拿下江南，打出“撥亂反正，誅殺假太子”的口號，大軍浩浩蕩蕩出發(fā)，左良玉帶六萬軍隊從陸路出發(fā)，派遣他的兒子左夢庚帶四萬水師從長江進攻南京，號稱二十萬。
在得到左良玉要打過來的消息后，朱慈烺立馬返回南京城，召集來了內(nèi)閣首輔史可法、文華殿大學(xué)士堵胤錫、大明禁軍孫守法、兵部尚書陳子龍、浙江總督方國安以及江西總督袁繼咸等人在文華殿議事。
朱慈烺看著自己一步步壯大的領(lǐng)導(dǎo)班子，非常的自豪，從杭州城一隅之地先殺朱由崧，再剿滅弘光政權(quán)的剩余叛軍，從原先的一萬多杭州守備擴張到現(xiàn)在的二十萬大軍，已經(jīng)統(tǒng)一了江南，坐擁江西、江蘇、安徽、浙江四座行省，但如今還不能掉以輕心，不能跟左良玉的軍隊硬拼消耗自身的實習(xí)，作為穿越人，朱慈烺心中明白，李自成的軍隊很快就會被清軍打的連連大敗，到時就得與清軍進行正面對決，那時清軍的實力將達到巔峰，還得早做準備，及早結(jié)束戰(zhàn)事，恢復(fù)江南的經(jīng)濟，整軍備戰(zhàn)，才有希望擊敗大清，統(tǒng)一明帝國。
朱慈烺“諸位都是我大明的重臣，我們才剛剛收復(fù)江南，叛臣左良玉就帶數(shù)十萬大軍來進攻，這個人在臨行前還屠戮我大明子民，罪大惡極，我們一定要鏟除他，為民除害”
兵部尚書陳子龍義憤填膺回答道“左良玉此人不僅不擁戴殿下，還帶軍隊來進攻其心可誅，即使占領(lǐng)湖北，實力雄厚，但心中既無朝廷，也沒有百姓，民心盡失，他的軍隊人數(shù)就算再多，然全是裹挾我大明子民軍紀散漫，毫無戰(zhàn)斗力，只要他敗了就會一擁而散，不足為懼”
朱慈烺看了看大明的地圖，又看向了袁繼咸“袁總督，左良玉的軍隊雖然不足為患，但我們還是要穩(wěn)穩(wěn)的贏下這一仗，我觀地圖他想沿江而上，必須經(jīng)過你的轄區(qū)，你可要守好九江、南昌，不能讓左良玉水路并行”
袁繼咸立馬表示自己能守住“太子殿下，臣愿死戰(zhàn)九江府，為我大明江山盡心盡力，為殿下排憂解難，臣一定不會辜負殿下的圣恩，奉出畢生所學(xué)不讓左良玉的軍前進一步”
朱慈烺看著一片忠心的袁繼咸，也不是這么多要讓他跟左良玉死磕，真怕他一根筋打不過被左良玉殺了開口道“袁總督，我們現(xiàn)今的實力比叛臣左良玉強大很多，沒必要跟他死戰(zhàn)，你只需要跟他慢慢拖延，等先解決了左良玉的水師，我們合并一處就能滅了左良玉”
朱慈烺在安排了袁繼咸的任務(wù)以后，繼續(xù)了下一步計劃“另外何將軍你先回到湖南，等叛臣左良玉在江西跟袁總督打的焦灼時候趁機收復(fù)湖北，斷了左將的后路。孫將軍你帶領(lǐng)從弘光政權(quán)招降的水師替我抵御左軍的水師，等他后路一斷，敵軍將不攻自破”
文華殿的各個大臣在聽了朱慈烺的安排，十分佩服這位殿下的雄才偉略，再也不敢因年紀小而輕視，紛紛夸贊朱慈烺如太祖皇帝在世，大明中興有望，隨后各自回去準備戰(zhàn)事。
左良玉事先并不知道袁繼咸已經(jīng)追隨朱慈烺，高家軍也加入他的軍隊只要再鼓動袁繼咸的部隊加入自己的陣營，就能大大增強自己的實力，和朱慈烺的軍隊未必沒有一戰(zhàn)之力。左良玉剛到九江府城門下，便派人去邀請江西總督袁繼咸，想讓他與自己一起造反，袁繼咸立刻大罵左良玉是小人，大明皇帝對你非常厚待，需要你的時候，你就冷眼旁觀，在湖北燒殺搶掠無惡不作，還敢說太子殿下是假的，你不配做我大明的臣子，我寧愿戰(zhàn)死也不會跟你這種人為伍，左良玉被這一頓罵的渾身顫抖，一口鮮血噴出就要倒下，左良玉部將張應(yīng)元立馬把左良玉扶了回去，左良玉的部將郝效忠見此情形只好鳴金收兵，等左良玉的安排。
左良玉本就年齡大了無法承受軍隊跋山涉水的折騰，這一氣直接病倒了在床上，只能安排他的心腹郝效忠和張興元立馬攻城，只要拿下九江府，拿著刀架在袁繼咸脖子上，看他還聽不聽話。
江西總督袁繼咸在知道左良玉病重的消息也不敢大意，生怕他是炸病，反正太子朱慈烺給他的命令就是守住江西，并不是打敗左軍，所以一直在死守，江西的三萬軍隊也全部被他調(diào)到了九江府，左軍也沒有碾壓的實力，進攻了十日一點效果都沒有。話說另一邊，左夢庚倒是沒有經(jīng)歷過什么像樣的戰(zhàn)斗，一路順江到達南京附近，其實是朱慈烺和方國安有意安排之下，把水師決戰(zhàn)拉到南京附近，一方面是為了讓他的軍隊遠離湖北，何騰蛟可以快速占領(lǐng)，另一方面讓左夢庚和左良玉的軍隊脫節(jié)逐一擊破。剛到南京附近的左夢庚在得知父親久攻不下九江府就想先撤回去跟左良玉回合，但是方國安的軍隊肯定不會讓他跑了，帶領(lǐng)剛訓(xùn)練沒多久的南京水師和揚州水師跟左夢庚展開大戰(zhàn)，雙方都沒有明顯的優(yōu)勢，慢慢陷入了拉鋸戰(zhàn)
隨著何騰蛟的軍隊占領(lǐng)湖北武昌，病重的左良玉再也支撐不住了病死在大營里，在得知父親病死武昌陷落，左夢庚方寸大亂再無戰(zhàn)斗的想法，立馬拋棄陷入戰(zhàn)爭中的船隊，自己帶著幾百名親衛(wèi)坐上小船向自己父親那邊跑去。